Лаборатория по биоинформатика "Биоинфотех"

За лабораторията

Лабораторията БиоИнфоТех работи в областта на биоинформатиката, биоавтоматиката и биоинженерството. Ние развиваме най-новите отрасли в областта на биотехнологиите, синтетичната биология, системната биологията, биомедицинското приборостроене и биоинформатиката.

Дейности

Внедряване на най-новите технологии в области като генетика (следващо поколение ДНК секвениране, CRISPR), метагеномика, биомедицинско оборудване за репродуктивна медицина, микрофлуиди, нови биопроцеси и т.н.

Въвеждане на нови технологии за секвениране, които водят до бързото разчитане на една молекула ДНК в рамките на 10-15 минути.

Разработване на нов софтуер за индексиране за метагеномиката, който успява да открие всички биологични видове, съществуващи в екологична, хранителна или медицинска проба в рамките на няколко часа.

Работа с новооткрити метаболитни възможности на бактериите за генериране на метан от електроенергия.

Разработваме свои собствени устройства за откриване на глутен.

Създадохме и първия български студентски отбор по синтетична биология, който спечели сребърен медал в своята област на конкурса iGEM 2017 в Бостън (Масачузетс).

Проекти

Текущи проекти

Разработка на автоматизирана система за изграждане на виртуални метаболитни мрежи. Тази система ще позволи ускорена развойна дейност в областта на системната биология и биоинформатиката с потенциално приложение в областта на индустриалните биотехнологии, фармацията и синтеза на целеви вещества, базиран на ретросинтетични метаболитни пътища.

Разработка на нов подход при решаването на оптимизационната задача за анализ на баланса на потоците в метаболитни мрежи. Това ще позволи да се правят не само количествени, но и качествени подобрения в ефективността на биотехнологичните процеси със съответно приложение в индустриалните биотехнологии.

Разработване на технически средства за подпомагане на лабораторните дейности, свързани с асистираната репродукция в хуманната и във ветеринарната медицина. Разработката се извърши съвместно с партньорски организации.

Разработване на технически средства за подпомагане на лабораторните дейности, свързани с експресното засичане на патогени в течни проби (кръвни, хранителни и др.).

Разработване на технически средства за подпомагане на лабораторните дейности, свързани с високоефективно охарактеризиране на нови щамове-свръхпродуценти. Устройствата ще позволяват паралелно провеждане на множество експерименти при строго контролирани условия на средата (състав, химични и физични свойства).

Разработване на високоефективни методи за постпроцесна обработка на биотехнологични култури за извличане на белтъци и други активни субстанции с приложение в диететиката, хуманната и ветеринарна медицина.

Изследване приложението на рентгеново лъчение като алтернатива на гама лъчението при третиране на биоактивни субстанции. Водени са предварителни разговори с водещи клиники по онкология и хематология.

Изследване на потенциала и разработване на методи и средства за приложения на стволови клетки при терапии за лечение на нелечими засега заболявания, като болестта на Паркинсон, болестта на Алцхаймер, диабет тип І, инфаркт на миокарда и др.

Изследване на възможностите за биотехнологично производство на специфични аминокиселини от субстрати с нулева или отрицателна стойност.

Приключени проекти

Разработка на цялостна система за анализ на данни от метагеномни генетични изследвания.

Услуги и Оборудване

Услуги

Подобряване на щамове по спецификация на клиента;
В зависимост от степента на близост между изходния и целевия щам;
Персонализирано генетично секвениране (чрез подизпълнител или от БиоИнфоТех);
Генетично манипулиране на микроорганизми по спецификация на клиента;
Изработка на микрофлуидни прототипи и други микроструктури;
Разработване на специализирана изследователска апаратура;
Изготвяне на анализ и пред проектно проучване ;
Разработване на специфични флуоресцентни (microarray) биочипове (чрез подизпълнител);
Съхранение на щамове;
Съхранение на клетъчни и тъканни култури;
Разработка на биоинформатичен софтуер;
Изготвяне на анализ и пред проектно проучване ;
Анализ на метагеномни данни;
Метагеномно секвениране